Ruptura e recuperação do microbioma nasal após tratamento com mupirocina em portadores e não portadores de Staphylococcus aureus

Scientific Reports volume 12, Número do artigo: 19738 (2022) Citar este artigo

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Os procedimentos de descolonização nasal contra o patógeno oportunista Staphylococcus aureus dependem do uso de antimicrobianos tópicos, cujo impacto na microbiota nasal é pouco conhecido. Examinamos esse impacto em portadores e não portadores saudáveis ​​de S. aureus. Este é um estudo prospectivo de coorte intervencionista de 8 portadores de S. aureus e 8 não portadores tratados com mupirocina nasal e banhos de clorexidina. Swabs nasais sequenciais foram coletados ao longo de 6 meses. S. aureus foi detectado por cultura quantitativa e genotipado usando spa typing. O metabarcoding em nível de espécie 16S baseado em RNA foi usado para avaliar a diversidade microbiana viva. As espécies Dolosigranulum pigrum, Moraxella nonliquefaciens e Corynebacterium propinquum correlacionaram-se negativamente com o transporte de S. aureus. O tratamento com mupirocina eliminou efetivamente S. aureus, D. pigrum e M. nonliquefaciens, mas não corinebactérias. A recolonização de S. aureus em portadores ocorreu mais rapidamente do que a recolonização pela espécie dominante em não portadores (mediana 3 vs. 6 meses, respectivamente). A maioria dos isolados de S. aureus recolonizadores tinha o mesmo tipo de spa do isolado inicial. O impacto do tratamento com mupirocina-clorexidina na microbiota nasal ainda era detectável após 6 meses. A recolonização do S. aureus antecedeu a recuperação da microbiota, enfatizando a forte adaptação desse patógeno ao nicho nasal e a eficácia transitória do procedimento de descolonização.

Staphylococcus aureus é um patógeno oportunista e causa frequente de infecções graves. Aproximadamente 20% da população geral são portadores persistentes de S. aureus e outros 30% são portadores intermitentes1. S. aureus é comumente transportado no nariz e menos frequentemente na garganta, pele e períneo1.

Portadores de Staphylococcus aureus apresentam maior risco de infecção após procedimentos invasivos e cirurgias2,3. Para prevenir infecções, vários países recomendam a eliminação do S. aureus do nariz antes da intervenção de risco usando um procedimento de descolonização4. Isso geralmente envolve tratamento antimicrobiano tópico com pomada nasal de mupirocina com ou sem clorexidina corporal cutânea e lavagem do cabelo. Diferentes abordagens de descolonização têm surgido devido a custos e questões organizacionais na atenção à saúde5. Enquanto alguns aconselham tratar todos os pacientes submetidos a intervenções de risco, outros limitam a descolonização apenas aos portadores confirmados.

Embora saibamos que a composição do microbioma nasal está relacionada à presença de S. aureus6,7, o impacto dos procedimentos de descolonização na microbiota nasal ainda não é totalmente compreendido. Em estudos anteriores do microbioma nasal, o transporte de S. aureus foi associado a maiores abundâncias relativas de Cutibacterium acnes, Corynebacterium accolens e estafilococos não aureus, e a menores abundâncias de Corynebacterium pseudodiphtheriticum, Dolosigranulum spp. e Cutibacterium granulosum6,7. Essas associações sugerem que a distribuição de espécies microbianas no nariz influencia a persistência de S. aureus, possivelmente através da competição por nutrientes e sítios de ligação epiteliais8. Por sua vez, a alteração da distribuição microbiana após um procedimento de descolonização pode afetar a probabilidade de recolonização persistente de S. aureus e, do ponto de vista clínico, de falha na descolonização. No entanto, a magnitude e a duração das alterações da microbiota após a descolonização não estão elucidadas. Até agora, um estudo de microbioma de um único paciente encontrou mudanças na composição e biodiversidade da microbiota nasal após o tratamento com mupirocina9, contrastando com um estudo culturômico anterior de 5 voluntários saudáveis ​​em que nenhuma mudança significativa na riqueza e diversidade da microbiota foi encontrada até 1 mês após a descolonização10.

Para decifrar as relações entre o transporte nasal de S. aureus, a microbiota nasal e os procedimentos de descolonização, realizamos um estudo prospectivo de coorte intervencionista de portadores e não portadores de S. aureus, monitorando as mudanças na comunidade microbiana ao longo de 6 meses após o tratamento com mupirocina-clorexidina. Usando culturas quantitativas e metabarcoding 16S, examinamos o impacto da descolonização nas comunidades bacterianas e o atraso na recolonização com S. aureus e outras espécies dominantes.